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微生物组是生活在体内和体外的微生物（由真菌、细菌、噬菌体、病毒和原生动物组成）的集体基因组。据CRI元哲分析，在2011-2020年，全球微生物组临床研究的数量一直在显著增长，这是因为DNA测序的成本大大降低，使得复杂混合物中的微生物能够通过基因组来定义。据CRI元哲分析，全球市场上的微生物组疗法主要由赛诺菲和大正制药等企业提供。但由于新企业不断涌入，以及最大化治疗产出和最小化副作用相关的创新有所增加，市场格局已经逐渐发生了改变。根据CRI元哲估算，2020年，全球微生物组疗法市场规模大约4.45亿美元，预计在2021-2030年仍然保持25%以上的年增速。